Doświadczony obrońca, 31-letni Jakub Bartkowski podpisał dwuletni kontrakt z Wartą Poznań i został jej zawodnikiem na zasadzie wolnego transferu po tym, jak rozwiązał umowę z Lechią Gdańsk.

Urodzony w Łodzi piłkarz rozpoczął karierę w klubie LZS Różyca, z którego trafił do Widzewa Łódź. W jego barwach Jakub Bartkowski zadebiutował w Ekstraklasie, jako 19-latek, latem 2011 roku. Potem występował jeszcze w Wiśle Kraków, Pogoni Szczecin, a ostatnie pół roku spędził w Lechii Gdańsk. Do dziś rozegrał w najwyższej lidze 207 meczów, strzelił w nich 7 goli i zaliczył 24 asysty. W latach 2014-16 był graczem Wigier Suwałki, z którymi awansował do I ligi. W ostatnim sezonie zanotował 30 występów w PKO Bank Polski Ekstraklasie – 14 w Pogoni Szczecin w rundzie jesiennej i 16 wiosną w Lechii Gdańsk. Dla „Portowców” zdobył dwie bramki: w starciu z KR Reykjavik w eliminacjach do Ligi Konferencji Europy oraz przeciwko Legii Warszawa; wiosną natomiast wpisał się na listę strzelców w pojedynku Lechii z Cracovią.

Po zimowym transferze Jakub Bartkowski miał umowę z klubem z Trójmiasta do czerwca 2025 roku, ale została ona właśnie rozwiązana i piłkarz mógł jako wolny zawodnik podpisać kontrakt z Wartą Poznań do końca sezonu 2024/25.